理系優位説に異を唱える人も
京大の調査結果はネット上でも話題になり、2ちゃんねるやツイッターには「理系は管理職になれなくても、駅弁大学で600近く保証っぽいね」と納得するものや、「男の方が年収高いから、男女混ぜると男が多い理系の方が高めになる」といった見方が寄せられた。
理系優位説に異を唱える人もいる。ジャーナリストの団藤保晴さんはオピニオンサイト「BLOGOS」に「『理系が文系より高給』京大さん、それは無茶」（8月25日付け）という反論記事を投稿している。
人事院の09年民間給与実態調査では、「事務課長」「支店長」などの文系職種の方が「技術課長」などの理系職種よりも全般的に給与が高い。これが京大の調査結果と相容れないとし、「きちんとした公的な調査があるのにインターネット調査に頼るのは無茶、無謀」と主張している。しかしコメント欄には「理系出身の支店長だっているし、全然比較になってない」といった指摘も書き込まれている。