厚生労働省は、新型インフルエンザワクチン接種における優先順位の計画案を2009年9月4日、公表した。それによると、「最優先」されるのは医療従事者（100万人）。ついで、妊婦（100万人）、持病がある人（900万人）、1歳未満から就学前の子ども（600万人）、1歳未満の子どもの両親（200万人）の順。そのほか、「優先」する人として、重症化リスクがある小・中・高校生（1400万人）、高齢者（2100万人）としている。なお、国内で生産できるワクチンは1800万人分とみられており、それ以外は輸入する方針。また、国産ワクチンの出荷がはじまるのは10月下旬頃。